イハラ クニオ   IHARA Kunio   井原　邦夫    所属   広島修道大学  健康科学部    職種   教授
言語種別	英語
発行・発表の年月	2016/07
形態種別	学術論文
標題	A Robust Analytical Pipeline for Genome-Wide Identification of the Genes Regulated by a Transcription Factor: Combinatorial Analysis Performed Using gSELEX-Seq and RNA-Seq
執筆形態	共著
掲載区分	国外
著者・共著者	Kojima T, Kunitake E, Ihara K, Kobayashi T, Nakano H.
概要	アスペルギルス・ニドゥランスの転写因子AmyRが制御する遺伝子群を同定するため、gSELEX-SeqとRNA-Seqを組み合わせた解析パイプラインを構築した。gSELEX-SeqでAmyR結合配列を選抜し、RNA-SeqによりamyR欠損株と野生株の発現変動を比較した。両者の結果を統合することで、AmyRによって直接制御される遺伝子を高精度で同定可能となり、転写因子標的遺伝子の網羅的同定に有効な手法であることを示した。